7月旬至8月中旬，广元市水磨沟省级自然保护区组织技术人员开展了灾后首次野生动植物巡护监测活动。此次监测完成了对保护区内7条固定样线的巡护，对区内野生动植物的灾后生存环境及其活动分布进行了数据的收集，完成了GIS信息系统数据的更新，同时就5.12地震灾害对保护区野生动植物所造成的损失进行了调查评估。
    此次野外调查共发现鸟类痕迹309处，主要有红腹锦鸡、雀鹰、普通鵟、猫头鹰、鹧鸪、八声杜鹃、雉鸡、红嘴蓝雀、红嘴相思鸟等共计102种；兽类痕迹124处，包括林麝、猕猴、狗獾、花面狸、黄喉貂、小麂、野猪等共计38种，其中：国家Ⅰ级保护动物林麝痕迹31处，而且多年没发现痕迹的国家Ⅱ级保护动物-狼，也出现了踪迹；此次监测还对红豆杉、连香树、珙桐、巴山榧、蓖子三尖杉、水青树、独花兰等12种重点保护植物进行了样方调查；调查发现5.12地震及持续不断余震对保护区造成山体滑坡50余处，受损林地7000余亩，滚石砸死的各种动物尸体多达30余处，以花面狸、小麂、毛冠鹿、红腹锦鸡等小型动物为主。
    通过调查，可喜的看到，虽然部分野生动物的栖息地及种群受到破坏，但保护区内野生动物总体情况较好，地震对野生动植物的影响不大。此次活动的开展，不仅掌握了灾后野生动植物的生长和野生动物活动的情况，更重要的是为灾后重建收集了数据，对国家制订保护区重建规划提供了科学详实的依据据，为保护区开展灾后重建及生态环境恢复工作作好了充分的准备。